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La flor de la cayena se compone de varias partes:

El Péndulo Floral: Culmina en un ensanchamiento al que también se le conoce cómo tálamo o receptáculo, donde se insertan los demás elementos que componen los órganos sexuales de la planta. Estos están protegidos por una estructura envolvente a la que se le denomina perianto, donde pueden distinguirse las partes principales a las que se denominan Cáliz y Corola. A las flores que presentan este tipo de estructura se les conoce como Heteroclamídeas.

El Cáliz: Es una estructura de protección. Se encuentra en la parte externa y suele ser de color verde. Está formado por cinco (5) gamosépalos, aunque estos pueden estar separados, por lo cual el tipo de Cáliz se puede llamar Carisépalo o Dialisépalo. También se presenta un Paracáliz, con 7 dialisépalos, por encima y detrás del Cáliz..

La Corola: Es el órgano interno y se compone de varios pétalos. El tubo estaminal conspicuamente excede la corola. Corola de 12-18 cm de diámetro.

El Androceo: Está constituido por un conjunto de filamentos llamados estambres se encuentran desde 10 hasta 15 aproximadamente y se proyectan desde el tubo estaminal del estilo. Es el órgano sexual masculino y el encargado de producir los granos de polen. Las anteras se componen de los cuerpos cavernosos o tecas en forma de globo hueco que contienen los sacos polínicos.

El Gineceo: Constituye el ovario de la flor y órgano sexual femenino. En la Cayena se encuentra unido o fusionado con el Androceo, formando lo que se conoce como el Ginostemio. Tiene una posición súpera, es decir, por encima del receptáculo, por lo que se habla de una flor Hipógina.