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No sabría darte una respuesta sobre la falta de bootmgr, pero te puedo indicar la forma más simple y segura de crear un USB booteable.

Solo necesitas:

La imagen de disco de Ubuntu: http://www.ubuntu.com/download/desktop

Y éste programa: http://www.pendrivelinux.com/universal-usb-install...

Usando el universal-usb-installer solo seleccionas el archivo ISO de ubuntu, la memoria USB donde copiaras los archivos, oprimes el botón de iniciar y esperas a que termine.

Espero soluciones tu problema

acá está lo que buscas la respuesta precisa y concisa de microsoft soporte para estos casos

Mensaje de error de Windows "Falta Bootmgr, presione Ctrl+Alt+Supr para reiniciar"

Resumen

Cuando intenta iniciar Windows, puede aparecer el siguiente mensaje de error:

Falta Bootmgr, presione Ctrl+Alt+Supr para reiniciar

Este error indica que falta el sector de arranque o que está dañado.

Solución

Utilice los métodos siguientes para solucionar este error. Comience con el método 1 y si con este método no se resuelve el problema, vaya al método 2.

Method 1: Run Startup Repair from Windows Recovery Environment (WinRE)

Method 2: Rebuild the BCD from Windows Recovery Environment (WinRE)

Method 3: Run System Restore from Windows Recovery Environment (WinRE)

Method 4: Use Startup Repair on a computer that has a preinstalled recovery option on your computer

http://support.microsoft.com/kb/2622803/es#applies...

La información de este artículo se refiere a:

Windows Vista Starter

Windows Vista Home Basic

Windows Vista Home Premium

Windows Vista Business

Windows Vista Enterprise

Windows Vista Ultimate

Windows 7 Starter

Windows 7 Home Basic

Windows 7 Home Premium

Windows 7 Enterprise

Windows 7 Professional

Windows 7 Ultimate

Palabras clave:

KB2622803

otros tips de ayuda y soporte para vista, 7

Utilice la herramienta Bootrec.exe en el entorno de recuperación de Windows para solucionar problemas y reparar problemas de inicio en Windows

http://support.microsoft.com/kb/927392#appliesto

Cómo realizar un inicio limpio para solucionar un problema en Windows Vista, Windows 7 o Windows 8

http://support.microsoft.com/kb/929135/es#method4

Repara errores de Windows 7 en un click con Fix It Center

http://www.softzone.es/repara-errores-de-windows-7...

y también de dejo un tuto muy bueno desde taringa para tu tarea de hacer booteable un usb con el comando DOS de windows DISKPART es muy buen tuto a mi me ha servido de mucho salu2.

http://www.taringa.net/posts/info/5476147/Bootear-...

bueno no e probado todas las versiones de linux pero algunos de ubuntu tienen la opcion de pasar o instalar en la usb. mete el disco y arranca desde el cd. como si fueras a formatear. en las opciones debe estar el instalar en una usb (ten cuidado en la letra de tu memoria usb no vayas a borrar windows) y lo hara solo al terminar tendras una usb booteable. y el mensaje q te aparece es porque dejas la memoria insertada y primero busca el so en la memoria en vez del disco duro y al no encontrarlo no arranca y te pide que reinicies. eso es algo facil de hacer salu2 espero t ayude y para mejor informacion aqui esta una forma mas facil de hacerlo http://www.taringa.net/posts/linux/5351493/Instala...