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As danito said: ANwesend.

and: starke (without "s")

die Kopfschmerzen - starke Kopfschmerzen

das Kopfweh - starkes Kopfweh

Bitte entschuldigen Sie, dass ich gestern in der Schule nicht anwesend war. Ich hatte starke Kopfschmerzen und ein wenig Fieber. Danke für Ihr Verständnis.

I guess you wanted to say "nicht ANwesend" (not present)...

"nicht ABwesend" means 'not absent'.

besides, you should leave out the "mich" and place a comma after "Sie", to indicate the subordinate clause.

EDIT: oh yeah right... it's "starke" Kopfschmerzen.

and btw your German is really good.