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No es lo mismo, ya que péptido es una molécula formada por la unión del grupo amino de un aminoácido con el grupo carboxilo de otro (enlace peptídico) llegando a formar UNA cadena polipetídica, mientras que con protomero nos referimos a cada una de las cadenas polipéptidicas individuales que forman la proteína oligomérica (proteínas complejas formadas por mas de una cadena polipeptidica). Espero te sirva.