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Philae no es un templo, sino una isla en el Nilo, y por eso al templo se le llama de manera común Templo de Philae. Este nombre se le quedó a pesar de que ya no se encuentra en esa isla. Al igual que los templos de Abu Simbel, este templo fue desmantelado y reconstruido en otra isla llamada Agilkia. La diferencia es que este templo, desde la construcción de la primera presa fue afectado y permanecía bajo las aguas durante varios meses al año, por lo que ha sufrido el desgaste de las aguas por mucho tiempo. Aún así se encuentra muy conservado y más aún ahora en su nuevo emplazamiento para evitar su total destrucción.

El templo está dedicado a la diosa Isis y fue construido durante las últimas dinastías del Imperio Faraónico e incluso durante la dominación romana, ya que Isis, a pesar de ser una de las diosas más antiguas de Egipto, su culto se extendió a los dominios romanos y griegos con gran facilidad. Al parecer, desde tiempos remotos ya existía en este lugar un pequeño templo dedicado al dios alfarero Jnum, pero es hasta las últimas dinastías cuando este sitio es renovado y consagrado a Isis, logrando su máximo esplendor.

Este templo fue de los últimos que siguió profesando su culto original cuando el emperador romano Justiniano ordenó suprimir el culto a dioses paganos.

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