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Hola amigo tu dudq tiene fqcil respueste jeje no la aplicacion no se desinstalara solo se desinstalara el aptoide asi que hazlo sin temores. espero haberte ayudado.saludos :)

no se borra pero si se borra la aplicacion q descargast ya q esta se guarda en una carpeta q se llama apks y lo encuentas en esta ruta .aptoide/apks y si no encuentas esta carpeta en tu administrador de archivos es porq esta escondida por eso tiene al principio un punto en caso de q no t aparesca descargat otra administrador de archivos q si le aparesca para q vayas a esa carpeta y copies la aplicacion q descargast y asi no lo pierdas al momento de desinstalar aptoide

en algunos celus la carpeta de aptoide no se borra al momento de desinstalarla o en algunos administradores si son visibles estas carpetas y si no lo puedes configurar para q sean visibles