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La neta hermano no los archvos son independientes a las aplicaciones, si borras winrar, no se borran tus archivos solo ya no podras abrirlos, si tienes dudas los archivos de winrar los buscas como extencion *.rar, *.zip, *.jar, *.iso, etc, si borras o ya no te gusta winrar usa winzip o alun otro comppresor y te daras cuenta que tus archivos siguen hay.

No. Los archivos y el programa son cosas independientes.