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mira proto:es un prefijo de origen griego utilizado en castellano para indicar algo que está primero en tiempo o en orden, que es inicial o primitivo, o para denotar superioridad.

y pre: (Del latín prae). Prefijo. Significa anterioridad local o temporal, prioridad o encarecimiento. Ejemplos: prefijar, prehistoria, prepósito, preclaro.

Espero que te sea útil. Suerte

proto es primer

pre es antes

en tu ejemplo:

protodinástico= primer dinastía

predinástico= antes de la dinastía

estoy buscando el significado de protofábula